在位于伊利诺伊州皮奥里亚的ARS国家农业利用研究中心(NCAUR)，ARS化学家BadalSaha进行了一项为期5年的研究，该研究检查了小麦秸秆-谷物收获后留下的作物残茬-是否可能纤维素乙醇生产的商业潜力。

Saha发现，当用碱性过氧化物预处理然后用酶分解时，他可以接触和发酵生物食品中的几乎所有植物糖。该过程甚至释放出植物细胞壁中难以接触的糖，这显着提高了每吨小麦秸秆的总乙醇产量至约93加仑。

但是，促进发酵的相同环境也可以培育“感染”乙醇生产设施并破坏产量的微生物。ARS遗传学家TimLeathers从商业乙醇设施的样品中收集细菌，包括从未使用抗生素的湿磨设施和在细菌爆发后定期给予抗生素的干磨设施。他发现从这两个设施中收集的大部分细菌分离物都是不同类型的乳酸菌。

同时，ARS微生物学家KenBischoff开发了一种模拟细菌污染和感染的模型。他发现，当测试培养物接种发酵乳杆菌(Lactobacillusfermentum)-乙醇植物中最常见的细菌感染源之一-乙醇产量下降了27%。有时“感染”可以用抗生素治愈，但他也发现了一种已经对治疗有抵抗力的细菌菌株。

从这项研究结果已发表在多家期刊，包括生物技术和生物工程，该杂志生物基材料和生物能源，和河北工业微生物学和生物技术。